根據(jù)目的和功能可分類，其中最重要的兩類是選擇培養(yǎng)基和鑒別培養(yǎng)基。選擇培養(yǎng)基是指在營養(yǎng)介質(zhì)中加入了一些特殊物質(zhì)，讓我們需要的微生物才能夠生長。比如在培養(yǎng)基中加入了慶大霉素，那么只有能夠抵抗慶大霉素的微生物才能夠生長，而這種抵抗多數(shù)情況下是我們在這些微生物的基因中插入了抗性基因后才具有的功能。

　　鑒別培養(yǎng)基用于鑒別不同類型微生物的培養(yǎng)基。在培養(yǎng)基中加入某種特殊的化學(xué)物質(zhì)后，導(dǎo)致不同微生物在培養(yǎng)基上生長后，產(chǎn)生明顯的特征性變化，根據(jù)這種特征性變化，可將該種微生物與其他微生物區(qū)分開來。比如使用酸堿指示劑可以區(qū)別產(chǎn)酸菌和產(chǎn)堿菌。

　　一、發(fā)酵培養(yǎng)皿的營養(yǎng)成分

　　微生物的食物在發(fā)酵上的俗語叫培養(yǎng)基。培養(yǎng)基是指供給微生物生長繁殖的，由不同營養(yǎng)物質(zhì)組合，由人類配制而成的營養(yǎng)基質(zhì)。碳水化合物、含氮物質(zhì)、無機鹽（包括微量元素）、維生素和水等幾大類物質(zhì)是培養(yǎng)基應(yīng)該包含的成分。

　　1.碳源營養(yǎng)物質(zhì)

　　碳源主要指碳水化合物，它是碳、氫和氧三種元素組成的化合物，包括葡萄糖，淀粉等，前者是單糖，后者是多糖。它們在生命體內(nèi)分解，然后形成能量和重要的基本單元，這些能源和基本單元成為微生物體內(nèi)合成蛋白質(zhì)，核酸等功能性大分子的基礎(chǔ)。

　　2.氮源營養(yǎng)物質(zhì)

　　氮源是指含有氮元素的營養(yǎng)物質(zhì)，分兩類，一類是無機氮源，如氨水，硫酸銨，尿素等；另一類是有機氮源，如氨基酸，蛋白質(zhì)等。它們在微生物體內(nèi)被分解和利用，是合成蛋白質(zhì)的重要原料。

　　3.其他營養(yǎng)物質(zhì)

　　無機鹽也起到重要作用，一方面它們是微生物體內(nèi)催化劑的激活劑，另一方面可以調(diào)節(jié)細胞的滲透壓。

　　二、培養(yǎng)基的分類

　　1.根據(jù)原料分類

　　根據(jù)配制原料的來源可分為天然培養(yǎng)基、合成培養(yǎng)基、半合成培養(yǎng)基。

　　天然培養(yǎng)基，顧名思義，原料取自天然，或者將天然產(chǎn)物簡單處理后獲得的營養(yǎng)物質(zhì)組合，比如玉米，玉米粉，玉米漿，比如牛肉，牛肉膏，酵母粉，魚粉，淀粉等；

　　合成培養(yǎng)基是指化學(xué)成分清楚，在制作時使用純凈物或近似純凈物，如葡萄糖、氯化鈉，氨基酸，維生素等，配制用的水一般也選擇純水；

　　半合成培養(yǎng)基又稱半組合培養(yǎng)基，指用天然原料加入一定的化學(xué)試劑配制而成的培養(yǎng)基。其中天然成分提供碳、氮源和生長素。化學(xué)試劑補充各種無機鹽。

　　2.根據(jù)形態(tài)分類

　　可分為固體培養(yǎng)基、液體培養(yǎng)基、半固體培養(yǎng)基；固體培養(yǎng)基可讓微生物生長在表面，液體培養(yǎng)基可讓微生物沉浸在其中，而且可以自由游動。半固體培養(yǎng)介于兩者之間，既以讓微生物沉浸在其中，但是不可自由流動。固體培養(yǎng)基一般是在液體培養(yǎng)中加入一些在常溫可凝固的物質(zhì)，如瓊脂等。

　　3.根據(jù)功能分類

　　微生物有生命，沒人知道他們是否喜歡吃菜還是喜歡吃米飯、饅頭？但是全面豐富的營養(yǎng)肯定是需要的，而且與人類相比，微生物的食譜更加廣泛，我們的食物不僅他們照單全收，我們不能享用的，也會成為他們的美肴。